中心实行主任负责制，自主管理，单独核算。战略管理委员会负责对中心申请的研究项目和重大建设项目进行投资审查和顾问监督；专家学术委员会负责审议中心研究方向、重大技术问题，并对研究目的和进展情况进行咨询和评估；副主任协助主任管理各部门工作；行政管理部负责中心各项日常事务的管理；财务部协助领导进行中心财务管理，在资金上保证公司经营活动的正常运行；推广部负责产品临床应用和中心成果的推广，以及中心的培训工作；质量检验部负责中心质量管理和质控规范标准的制定与实施；研发中心负责中心有关生命资源和低温保存项目的研究与开发，同时协助各相关科研部门进行新产品的开发；生命资源库负责提供高质量的组织和器官等产品。各部门相互协作配合，相互监督，形成一个有序的整体。